Depende de su forma de trabajar, por ejemplo:
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Si su contabilidad se la lleva una asesoría, puede ser conveniente que pida a sus proveedores que junto con la factura en PDF, le manden la factura en formato Verifactu, porque de esta forma su asesoría podrá importar los ficheros directamente a su contabilidad.
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Si usted introduce manualmente las facturas de proveedores en su programa de contabilidad, también se va a ahorrar mucho trabajo si le envían el fichero en formato Verifactu, ya que lo más probable es que su aplicación de Contabilidad le permita leer dicho fichero y automatizar en gran medida la contabilización de facturas de proveedores.
En cualquier caso, tener el fichero de la factura recibida en formato Verifactu guardado junto con la factura en PDF puede serle de utilidad en algún momento, con lo que nuestro consejo es que en la medida de lo posible solicite a sus proveedores la factura en PDF y también en formato Verifactu.