Si. Las facturas simplificadas también deben de incluir el código QR.
La razón es que la factura simplificada, lo que antes se conocía como un ticket de caja, a efectos fiscales no deja de ser una factura, la única diferencia es que en la factura simplificada no se incluyen los datos del cliente porque no supera el importe máximo que la ley establece para poder emitir una factura simplificada. Si se supera dicho límite se debe de emitir una factura con los datos del cliente.